根據(jù)醫(yī)院的規(guī)模、性質(zhì)和處理污水排放去向，進行工藝選擇。根據(jù)醫(yī)院分類，分為傳染病醫(yī)院和綜合醫(yī)院。醫(yī)院污水處理后排放去向分為排入自然水體和通過市政下水道排入城市污水處理廠兩類。醫(yī)院污水處理所用工藝必須確保處理出水達標，主要采用的三種工藝有：加強處理效果的一級處理、二級處理和簡易生化處理。
醫(yī)院污水處理成套設(shè)備在開機前做如下檢查工作：檢查污水處理一體化設(shè)備的風機油位是否正常，轉(zhuǎn)動是否靈活，地腳螺栓有無松動，開機前須將潤滑油加至標準油位，地腳螺栓須緊固，用手轉(zhuǎn)動風機應(yīng)無沉重感及異常響動，風機轉(zhuǎn)動方向須與運行方向一致。
醫(yī)院污水特別是方艙醫(yī)院污水其污水水質(zhì)性質(zhì)和生活污水差不多，不同就是污水內(nèi)可能菌群超標，需要在污水處理設(shè)備末尾的消毒工藝上適當延長污水消毒時間，醫(yī)院污水處理成套設(shè)備運行模式為全自動運行模式，可以去除污水當中的COD、BOD、氨氮、大腸桿菌等污染物。
為達到中出水水質(zhì)要求，本污水處理工藝包含預(yù)處理（格柵、調(diào)節(jié)池）、二級處理（生化+MBR池）、消毒等環(huán)節(jié)。
加強處理效果的一級強化處理適用于處理出水進入二級處理城市污水處理廠的綜合醫(yī)院。二級處理工藝適用于傳染病醫(yī)院(包括帶傳染病房的綜合醫(yī)院)和排入自然水體的綜合醫(yī)院污水處理。
